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ChimeraX AlphaFold

配合防疫: 2022年6月7日課程。


今天上課是來學習 ChimeraX AlphaFold 的功能,請打開 ChimeraX。

題目為:Predict a protein structure using AlphaFold within ChimeraX



AlphaFold2 的原始論文:

Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold

ChimeraX AlphaFold 的功能執行,內容包含 google 的雲端計算;

( ChimeraX AlphaFold Predict 為 goolge 雲端運算,

這個例子需要 40 分鍾以上的運算時間。)


跟著影片來操作練習,根據執行結果,回答問題交作業。


作業題目為:AlphaFold
1. AlphaFold Fetch 的功能是什麼?這個例子執行結果為何?(執行結果貼圖至 word。)
2. AlphaFold Search 的功能是什麼?這個例子執行結果為何?(執行結果貼圖至 word。)
3. AlphaFold Predict 的功能是什麼?這個例子執行結果為何?(執行結果貼圖至 word。)
(若出現錯誤訊息,則報告錯誤訊息為何。)
4. 寫到 MS Word 上,並交作業

HINT:

(for AlphaFold Search)
Hint02 9724cd46b366a8cc02b08921bf75734c95ffe97b6346d71053a1488fe3a14f18



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